Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scg2Q03517 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms