Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl7Q03366 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms