Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms