Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms