Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uba1Q02053 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uba1Q02053 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms