Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms