Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Flt3Q00342 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms