Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PgrQ00175 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PgrQ00175 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms