Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shc1P98083 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms