Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Scn1bP97952 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms