Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smn1P97801 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smn1P97801 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms