Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata5P97489 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata5P97489 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata5P97489 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms