Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms