Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nbr1P97432 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nbr1P97432 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nbr1P97432 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nbr1P97432 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nbr1P97432 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nbr1P97432 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nbr1P97432 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nbr1P97432 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms