Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp1P97350 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms