Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mesp1P97309 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mesp1P97309 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms