Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbx1P82976 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx1P82976 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms