Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms