Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb1P70662 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms