Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcr4P70658 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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