Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad50P70388 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms