Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ufd1P70362 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ufd1P70362 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ufd1P70362 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ufd1P70362 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ufd1P70362 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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