Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad1P70340 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms