Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms