Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd13P70217 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms