Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf6P70196 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf6P70196 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf6P70196 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms