Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms