Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms