Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snrpd3P62320 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snrpd3P62320 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms