Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpeP62305 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpeP62305 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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