Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz1P61924 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copz1P61924 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copz1P61924 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copz1P61924 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copz1P61924 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copz1P61924 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz1P61924 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz1P61924 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms