Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg6P61406 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg6P61406 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms