Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme3P61290 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms