Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ActbP60710 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ActbP60710 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ActbP60710 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ActbP60710 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ActbP60710 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ActbP60710 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ActbP60710 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ActbP60710 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ActbP60710 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ActbP60710 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ActbP60710 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ActbP60710 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ActbP60710 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ActbP60710 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ActbP60710 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ActbP60710 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ActbP60710 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ActbP60710 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ActbP60710 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ActbP60710 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ActbP60710 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ActbP60710 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ActbP60710 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ActbP60710 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ActbP60710 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ActbP60710 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ActbP60710 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ActbP60710 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ActbP60710 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms