Protein–RNA interactions for Protein: P59999

Arpc4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc4P59999 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Arpc4P59999 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Arpc4P59999 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arpc4P59999 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arpc4P59999 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arpc4P59999 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arpc4P59999 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arpc4P59999 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arpc4P59999 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arpc4P59999 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms