Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup43P59235 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup43P59235 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms