Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm2P58774 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms