Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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