Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms