Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bace1P56818 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Bace1P56818 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Bace1P56818 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bace1P56818 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Bace1P56818 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Bace1P56818 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms