Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd38P56528 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms