Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CartptP56388 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CartptP56388 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CartptP56388 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CartptP56388 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CartptP56388 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CartptP56388 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CartptP56388 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CartptP56388 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CartptP56388 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CartptP56388 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CartptP56388 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CartptP56388 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CartptP56388 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CartptP56388 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CartptP56388 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CartptP56388 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CartptP56388 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CartptP56388 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CartptP56388 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CartptP56388 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CartptP56388 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CartptP56388 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CartptP56388 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CartptP56388 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CartptP56388 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CartptP56388 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CartptP56388 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CartptP56388 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CartptP56388 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CartptP56388 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CartptP56388 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CartptP56388 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms