Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GemP55041 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GemP55041 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GemP55041 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GemP55041 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms