Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb1P52795 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb1P52795 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efnb1P52795 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Efnb1P52795 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Efnb1P52795 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Efnb1P52795 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Efnb1P52795 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efnb1P52795 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb1P52795 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb1P52795 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb1P52795 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb1P52795 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb1P52795 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb1P52795 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb1P52795 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb1P52795 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb1P52795 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb1P52795 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb1P52795 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb1P52795 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb1P52795 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efnb1P52795 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Efnb1P52795 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efnb1P52795 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efnb1P52795 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms