Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms