Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RorcP51450 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RorcP51450 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RorcP51450 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RorcP51450 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RorcP51450 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RorcP51450 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RorcP51450 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RorcP51450 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RorcP51450 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RorcP51450 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms