Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RoraP51448 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RoraP51448 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RoraP51448 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RoraP51448 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms