Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa8P50706 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms