Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms