Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms